本報訊:菲律賓科學家目前正試圖追踪菲國新冠肺炎的源頭,以便對疫情有更清晰的了解。
通過基因或基因組測序,科學家可以確定主要的新冠病毒毒株。基因或基因組測序是對組成生物體DNA或RNA的基因組進行解碼的過程,這些基因組是儲存遺傳信息的核酸類型。
菲國立大學的菲律賓基因組中心執行主任薩洛馬博士告訴記者,自從疫情爆發以來,他們已經對數百名患者的樣本進行測序。
在他們測序的樣本中,他們完成了6個完整的基因組序列,並提交給了全球共用流感數據倡議組織(GISAID)。GISAID是新冠病毒和其他病毒基因組數據的主要來源。除了熱帶醫學研究所的7個全基因組序列外,菲律賓總共提交了13個。
經過幾次測試,科學家們確定,將近一半的完整基因組序列含有與鑽石公主號上的病毒DNA相似。今年2月,鑽石公主號郵輪因700多名乘客感染了新冠肺炎而被迫停靠在日本。
她說:“我們的樣本很少,但在13個樣本中,有很多來自鑽石公主號郵輪。至少6個。而來自上海的就沒那麼多。也有一些來自歐洲。”
薩洛馬解釋,基因序列的某些突變使他們能夠確定病毒的具體毒株的來源國。她說,他們還能夠識別出只有菲律賓病人才有的基因序列中的某些變異。
她補充,他們在3月份檢測出沒有任何旅行史的患者所感染的毒株與鑽石公主號郵輪上的病毒株類似,這意味著他們在自己的社區中感染了新冠肺炎。
當400多名菲律賓船員被撤回國,他們在日本接受了檢測,甚至在新克拉克市又接受了14天的隔離。在隔離期間,只有兩人的檢測呈陽性。
目前還不清楚鑽石公主號郵輪上的病毒是如何在菲律賓其他地區傳播的,儘管世界衛生組織當時表示,對遣返者實施額外的檢疫期是一個正確的決定,因為疾病可能在稍後才會發作。
薩洛馬說,根據樣本的基因序列,來自鑽石公主的毒株起源於中國,然後到達日本、菲律賓和印度——這艘郵輪的許多船員都來自這些國家。
菲科學家們還從7月份的測序樣本中發現了一種模式,某種程度上證實了有關D614G,或簡稱為“G”的研究,它是病毒刺突區的一種單一氨基酸新變體,已經變得更加常見。
薩洛馬說:“我們在7月份進行了檢測,大多數樣本都有D614G突變。”
報告稱,在芝加哥和世界其他地區爆發的新冠肺炎疫情中,G型病毒佔主導地位。
薩洛馬解釋,突變並不總是壞事;可以是無害的,甚至可以降低病毒的傳染性。
她說:“有研究表明,雖然它是具傳染性的,但它不會讓你的住院時更長。這與嚴重程度無關。”